Skip to main content

Table 1 List of PsbX genes identified in Gossypium and their sequence physiochemical properties

From: Genome-wide identification and expression profiling of photosystem II (PsbX) gene family in upland cotton (Gossypium hirsutum L)

Gene ID

Name

Chr

Start /bp

End /bp

Strand

Number of amino acid

Mw /KDa

pI

#Most-Likely-Location

D5.v1.pred_00000384-RA

GrPsbX1

D05

2 614 382

2 614 753

 + 

120

12 373.49

10.4

CHLOROPLAST

D5.v1.pred_00033500-RA

GrPsbX2

D07

1 394 653

1 395 042

 + 

120

13 124.31

10.0

CHLOROPLAST

D5.v1.pred_00021191-RA

GrPsbX3

D13

54 975 179

54 975 553

_

120

12 625.86

10.7

CHLOROPLAST

D5.v1.pred_00021192-RA

GrPsbX4

D13

54 976 963

54 979 138

_

200

21 616.23

10.1

CHLOROPLAST

D5.v1.pred_00021193-RA

GrPsbX5

D13

54 983 135

54 983 509

_

120

12 731.94

10.7

CHLOROPLAST

Ga05G0346.1

GaPsbX1

A05

3 159 541

3 159 512

 + 

120

12 343.46

10.4

CHLOROPLAST

Ga07G0152.1

GaPsbX2

A07

1 699 142

1 699 531

 + 

120

13 122.32

10.0

CHLOROPLAST

Cotton_A_03158_BGI-A2_v1.0

GaPsbX3

A13

83 186 770

83 187 144

 + 

120

12 656.94

11.1

CHLOROPLAST

Ga13G2390.1

GaPsbX4

A13

119 166 072

119 166 446

_

120

12 639.87

10.5

CHLOROPLAST

Ga13G2391.1

GaPsbX5

A13

119 166 072

119 170 965

_

120

12 699.94

10.7

CHLOROPLAST

Ghir_A05G003380.1

GhPsbX1_At

A05

3 298 268

3 299 342

 + 

120

12 386.49

10.7

CHLOROPLAST

Ghir_A07G001470.1

GhPsbX2_At

A07

1 590 068

1 591 012

 + 

120

12 843.05

10.0

CHLOROPLAST

Ghir_A13G020450.1

GhPsbX3_At

A13

103 747 523

103 748 282

_

120

12 656.94

11.1

CHLOROPLAST

Ghir_A13G020460.1

GhPsbX4_At

A13

103 747 544

103 756 316

_

120

12 625.84

10.5

CHLOROPLAST

Ghir_A13G020470.1

GhPsbX5_At

A13

103 750 766

103 751 783

_

120

12 699.94

10.7

CHLOROPLAST

Ghir_D05G003520.1

GhPsbX1_Dt

D05

2 964 671

2 965 644

 + 

120

12 403.51

10.4

CHLOROPLAST

Ghir_D07G001490.1

GhPsbX2_Dt

D07

1 556 339

1 557 123

 + 

120

13 126.32

10.0

CHLOROPLAST

Ghir_D13G021280.1

GhPsbX3_Dt

D13

59 090 890

59 091 264

_

120

12 639.89

10.7

CHLOROPLAST

Ghir_D13G021290.1

GhPsbX4_Dt

D13

59 093 852

59 095 086

_

120

12 535.78

10.5

CHLOROPLAST

Ghir_D13G021300.1

GhPsbX5_Dt

D13

59 098 593

59 099 629

_

120

12 701.91

10.7

CHLOROPLAST

Gbar_A05G002930.1

GbPsbX1_At

A05

2 942 757

2 943 546

 + 

120

12 386.49

10.7

CHLOROPLAST

Gbar_A07G001500.1

GbPsbX2_At

A07

1 673 556

1 674 223

 + 

120

12 843.05

10.0

CHLOROPLAST

Gbar_A13G020900.1

GbPsbX3_At

A13

104 625 505

104 626 364

_

120

12 615.94

10.8

CHLOROPLAST

Gbar_A13G020910.1

GbPsbX4_At

A13

104 629 009

104 629 823

_

120

12 625.84

10.5

CHLOROPLAST

Gbar_A13G020920.1

GbPsbX5_At

A13

104 633 708

104 634 295

_

120

12 699.94

10.7

CHLOROPLAST

Gbar_D05G003370.1

GbPsbX1_Dt

D05

2 851 525

2 852 234

 + 

120

12 358.47

10.3

CHLOROPLAST

Gbar_D07G001490.1

GbPsbX2_Dt

D07

1 514 984

1 515 635

 + 

120

12 879.12

10.0

CHLOROPLAST

Gbar_D13G021280.1

GbPsbX3_Dt

D13

55 675 317

55 676 353

_

120

12 639.89

10.7

CHLOROPLAST

Gbar_D13G021290.1

GbPsbX4_Dt

D13

55 678 883

55 679 763

_

120

12 535.78

10.5

CHLOROPLAST

Gbar_D13G021300.1

GbPsbX5_Dt

D13

55 683 341

55 684 159

_

120

12 701.91

10.7

CHLOROPLAST